Koulu perustettiin vuonna 1914 nimellä Lohjan yhteiskoulu Anttilan tilan päärakennukseen. Vuonna 1917 koulu sai oman rakennuksen, jota nykyään kutsutaan Puu-Anttilaksi. Koulu siirtyi vuonna 1957 valtion omistukseen ja sai nimen Lohjan yhteislyseo, jossa oli keskikoulu ja lukio.
Peruskoulun tullessa Lohjalle koulu jakautui Lohjan lukioksi ja Anttilan yläasteeksi. Yläaste toimi aluksi kahdessa paikassa, Puu-Anttilassa ja Tytyrissä, kunnes koulu sai vuonna 1982 punatiilisen koulurakennuksen muutaman sadan metrin päähän Puu-Anttilasta. Vuonna 1994 koulu jakautui kahteen, kun Harjun yläaste aloitti toimintansa Harjun koulussa. Anttilan koulu jäi entisiin tiloihin. (lähde Wikipedia)
Puu-Anttila oli Länsi-Uudenmaan koulutuskeskuksen, Luksian omistuksessa vuoteen 2017 , jolloin Puu-Anttila myytiin kansanedustaja Eero Lehden edustamalle yritykselle. Puu-Anttilassa vuokralla toimineet Tanssikoulu ToeStar ja Puu-Anttilan Juhlapalvelut ostivat Puu-Anttilan syyskuussa 2024.